El Mar de Cortes es un cuerpo de agua protegido que resulta muy conveniente para la reproducción de especies marinas oceánicas, por lo que se convierte en diferentes temporadas en hogar temporal de varias especies de ballenas entre las que se encuentran Orcas, Ballenas Azules, Ballenas de Aleta, Jorobadas, Minkies, Cachalotes, Ballenas de Bride, etc., destacando entre todas la Ballena Gris, ya que si bien se alimenta en el Ártico, migra desde el Mar de Behring hasta la Península de Baja California, donde los individuos reproductivos se aparean y las hembras preñadas dan a luz, por lo que se le considera una Ballena Mexicana y se encuentra protegida por las leyes de este país.

Las principales zonas de arribazón de ballena gris son : Bahía Ojo de Liebre (Guerrero Negro, BCS), Laguna de San Ignacio (BCS), y Bahía Magdalena (Puerto San Carlos y Puerto Adolfo Lopez Mateos, BCS).  Estos complejos lagunares brindan un ambiente libre de depredadores y agua de mar mas densa, ayudando a que los ballenatos crezcan rapido y se preparen para el viaje de 8000 km de regreso a los lugares de alimentación en el Ártico.  Estos ballenatos desde que nacen se acostumbran a ver embarcaciones con turistas abordo, y siendo animales inteligentes, se dan cuenta de que esas embarcaciones no tienen la intención de lastimarlas -como era el caso de principio del siglo XX, cuando era legal la caza de ballenas por embarcaciones extranjeras-, por lo que son amistosos y sus madres tolerantes, ejerciendose una interacción entre humanos y ballenas único en el mundo.